La baia dove sorge il Shagra Village possiede una superba barriera corallina che ospita molte specie di pesci e una grande varietà di formazioni di corallo duro. La baia è poco profonda, da 10 metri di profondità fino a 40-50 metri della parete più esterna. Il programma di immersione di Marsa Shagra Village è studiato per soddisfare le esigenze dei subacquei di ogni livello: il pacchetto standard offre immersioni illimitate sull'house reef, la barriera adiacente al villaggio, e due immersioni guidate al giorno in gommone.
